Bio informatika merupakan ilmu yang mempelajari penerapan teknik komputasional untuk mengelola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika, dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis, terutama dengan menggunakan sekuens DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan dengannya. Contoh topik utama bidang ini meliputi basis data untuk mengelola informasi biologis, penyejajaran sekuens (sequence alignment), prediksi struktur untuk meramalkan bentuk struktur protein maupun struktur sekunder RNA, analisis filogenetik, dan analisis ekspresi gen.
Ilmu bio informatika lahir atas insiatif para ahli ilmu komputer berdasarkan artificial intelligence. Mereka berpikir bahwa semua gejala yang ada di alam ini bisa diuat secara artificial melalui simulasi dari gejala-gejala tersebut. Untuk mewujudkan hal ini diperlukan data-data yang yang menjadi kunci penentu tindak-tanduk gejala alam tersebut, yaitu gen yang meliputi DNA atau RNA. Bio informatika ini penting untuk manajemen data-data dari dunia biologi dan kedokteran modern. Perangkat utama Bio informatika adalah program software dan didukung oleh kesediaan internet.
contohnya BIOINFORMATIKA DALAM PEMULIAAN TANAMAN
Bioteknologi dianggap mampu menjawab tantangan yang tidak mampu dihadapi pemuliaan tanaman secara konvensional. Bioteknologi sebagai ilmu terapan mempunyai cakupan yang luas dan mampu diterapkan pada berbagai bidang misalnya pertanian, kedokteran, kehutanan dan bidang-bidang lain. Bioteknologi dalam pemuliaan tanaman merupakan jawaban atas keterbatasan pemuliaan tanaman secara konvensional. Dalam perkembangan bioteknologi dihadapkan pada permasalahan kompleksitas sistem biologi molekuler yang tidak hanya berdasar pada data kualitatif tapi juga data kuantitatif sehingga dalam memecahkan hal tersebut diperlukan metode komputasi yang secara efisien mampu melakukan penyimpanan data, hipotesa awal, konfirmasi, interprestasi, dan spekulasi terhadap data yang kita dapatkan.
Penemuan-penemuan kedepan tidak mustahil semua akan berbasis pada bioinformatika, mengapa bioinformatika begitu berdaya guna hal ini disebabkan karena secara garis besar bioinformatika dalam analisis datanya bersifat (Trimarsanto, 2003) :
1. Pendukung hipotesis awal, tapi bukan jawaban yang definitive
2. Pre- select targets
3. Mampu menemukan suatu pola yang seragam dalam suatu kumpulan data
Kelebihan bioinformatika tersebut tidak lepas perkembangan teknologi semikonduktor yang mampu menciptakan prosesor dengan kecepatan akses yang tinggi terhadap jutaan data yang terdapat pada database dengan menggunakan allogaritma tertentu dalam menentukan skor pembanding homologi antara sekuen DNA yang dinput dengan sekuen DNA yang ada pada database. Keberhasilan bioinformatik dalam bioteknologi sebagai contoh adalah (Trimarsanto, 2003) :
1.Human genome project lebih cepat tiga tahun dari yang diharapkan
2. Rice genome poject ,oleh China
3. Fugu fish project oleh Jepang
4.Perancangan obat antimalaria (Fosmidomycin)
Bioinformatika secara garis besar begitu penting dalam pengelolan diversitas yang berujung pada pemuliaan tanaman karena (Trimarsanto, 2003) :
1.Biology bukan lagi sebagai ilmu yang berkutat pada data kualitatif saja tetapi juga pada data kuantitatif.
2.Bioinformatika sebagai alat yang berguna dalam mengorganisasi data yang sangat kompleks, seperti tercermin dalam kompleksitas sistem biology
3. lebih ekonomis karena mampu melakukan prediksi dan interprestasi data tanpa harus melakukan banyak ulangan percobaan
4.Bioinformatika akan merubah cara peneliti dalam bekerja
Senin, 10 Mei 2010
Bio Informatika
Minggu, 04 April 2010
my aspiration
Cita-cita dik waktu kecil memang belum tahu apa-apa yang dipikirkan yaitu pingin menjadi pemain sepakbola timnas indonesia,itulah cita-cita pertama dik yang tersirat dalam pikirkan.
selang beranjak remaja yaitu SLTP dik mulai berubah pikiran karena bagaimanapun dokter lebih mulia karena membantu orang yang sakit,akhirnya keinginan dik berubah pingin jadi dokter...hehehehehee(meskipun itu rasanya berat)
tapi lambat laun waktu berjalan sendirinya dan SLTA pun beranjak,singkat cerita pada waktu mata kuliah biologi dik dan teman-teman lihat video operasi bedah yang diperagakan oleh dokter spesialis,ternyata apa yang terjadi ????
dik akhirnya mengundurkan diri menjadi dokter dengan alasan yang begitu gak masuk akal. mengapa??
karena dengan alasan pertama yaitu gak berani membedah perut orang dengan pisau operasi karena bagaimanpun itu perut bukan buah...hiiii ngeriii...akhirnya bulu punduk dik mulai berdiri dan putuslah harapan jadi dokter....
Setelah waktu mendekati ujian nasionaldik mulai berpikir lagi mau apa setelah lulus SLTA nich??
itu pertanyaan yang sangat membingungkan,karena dengan beberapa hari tidak ada jawaban sama sekali,akhirnya dik minta masukan ke beberapa orang seperti mother yag dik cintai,guru-guru,dan kakak dik.
Akhirnya dari masukan tersebut dik simpulkan pingin menjadi IT
di benak pikiran dik kirain IT itu bukan program2 yang dipelajari...
tapi nasi dah jadi bubur bagaimanapun pilihan itu adalah pilihan dik,jadi harus bisa beradaptasi dengan komputer meskipun dik baru punya komputer semester 4...hehehhehe......
Visi
Alhamdulilah waktu gak kerasa akhirnya aku sekarang sudah menjadi mahasiswa,,meskipun kuliah yang aku idolakan gak tercapai{UI} tapi aku bangga karena di kampus GUNADARMA inilah aku mulai megerti banget artinya pendidikan teknologi{IT} mskipun ane baru punya komputer semester 4 dan belum paham banget dgn komputer.tapi aku bertekad menjadi webmaster dan programmer yang handal???
Misi
Pingin menjadi orang yang berguna bagi bangsa dan negara,dan ingin rasanya membahagiakan orangtua dan keluarga dengan pekerjaan dik dikemudian hari,semoga itu terlaksana....Amien.....
Ubiquotious
Pernahkah anda mendengar ungkapan Ubiquitous Computing ? begitulah salah topic yang saya utarakan di wall facebook saya beberapa waktu yang lalu. Rata-rata menjawab tidak pernah, dan mungkin anda juga termasuk salah satunya. Istilah Ubiquitous Computing sebenarnya bukanlah istilah baru, karena pada tahun 1988, Mark Weiser, seorang peneliti senior pada Xerox Palo Alto Research Center (PARC) telah memproklamirkan istilah tersebut, sehingga beliau disebut sebagai bapak Ubiquitous Computing
Apasih Ubiquitous Computing itu sebenarnya ? secara sederhana dapat kita definisikan dengan istilah komputasi dimana-mana/komputasi yang ada dimana-mana, ubiquitous secara harfiah berarti muncul atau ada dimana-mana, computing bermakna komputer. Mungkin anda masih belum paham dengan maksud diatas. Mari kita telaah lagi, sejarah perkembangan komputer dimasa lalu dimulai dari computer main frame, yaitu sebuah computer server besar yang melayani banyak pengguna (user), sehingga dulu dikenal dengan satu komputer dengan banyak pengguna.
Kemudian era komputer bergeser kearah personal komputer, yaitu setiap orang mempunyai satu komputer, lalu muncul era internet, dimana seseorang dapat mengakses komputer lain tanpa dibatasi olek jarak dan ruang waktu. Maka generasi masa depan yang sudah di depan mata adalah ubiquitous computing, pada era ini manusia dapat melakukan interaksi dengan banyak komputer (one person for many computer). manusia dianalogikan sebagai computer client yang terhubung dengan sebuah server komputer, sehingga apapun kebutuhan manusia akan segera terpenuhi oleh layanan computer yang terintegrasi dan serba otomatis. Banyak kajian-kajian tentang Ubiquitous Computing masih terkesan seperti virtual, namun secara bertahap sudah mulai tampil ke dunia nyata.
A.Komputasi bergerak
Komputasi bergerak adalah juga dikenal sebagai peralatan telepon genggam, peralatan genggam, komputer genggam, palmtop atau hanya alat genggam — adalah sebuah peralatan komputer seukuran kantong, yang memiliki layar tampilan dengan masukan sentuhan atau papan ketik mini. Untuk personal digital assistant (PDA) masukan dan keluaran digabungkan ke dalam sebuah antarmuka layar sentuh. Telepon pintar (Smartphone) dan PDA sangat populer di antara orang-orang yang membutuhkan bantuan dan kenyamanan komputer konvensional. Enterprise digital assistant dapat memperluas fungsi yang tersedia untuk pengguna bisnis dengan menawarkan layanan pengambilan data terintegrasi seperti pembaca Bar Code, RFID, dan Smart Card.
contohnya sebagai berikut:
B.Perbandingan GSM dan CDMA
Dari aspek teknologi baik GSM maupun CDMA merupakan standar teknologi seluler digital, hanya bedanya GSM dikembangkan oleh Negara-negara eropa dan bersifat ‘open source’, sedangkan CDMA dari kubu Amerika dan Jepang. Yang perlu diperhatikan bahwa teknologi GSM dan CDMA berasal dari jalur yang berbeda, sehingga perkembangan ke generasi 2,5G dan 3G berikutnya akan berbeda terus. Teknologi CDMA didesain tidak peka terhadap interfensi, dan sejumlah pelanggan dalam satu sel dapat mengakses pita spectrum frekuensi secara bersama karena mempergunakan teknik pengkodean tertentu.
Ponsel CDMA ada dua jenis yakni tanpa kartu sehingga nomer panggilnya harus diprogram oleh petugas operator yang bersangkutan, dan satu lagi ponsel CDMA yang dilengkapi dengan RUIM (Removal User Identification Module) atau dalam istilah GSM dikenal dengan SIM Card. Ada sejumlah kelebihanyang ditawarkan CDMA. misalnya, komunikasi selular tidak lagi rawan radiasi, tidak lagi seperti suara robot, tidak terputus-putus.
CDMA menjadi booming yang lebih heboh dan bahkan sampai sekarang jumlah pelanggan semakin bertambah dengan cepat. Terutama karena layanan ini menjanjikan tarifyang lebih murah.
Sedangkan GSM memiliki keistimewaan yang tidak terdapat pada sistem analog maupun pada American Digital Cellular (ADC) yaitu adanya standarisasi interface antar masing-masing sub sistem. Dengan demikian, GSM menjanjikan suatu sistemyang tidak harus dimonopoli oleh satu merk. Dalam arti bahwa Switching,dan Base Station dapat berasal dari merek/pemasok yang berbeda. Kondisi ini jelas sangat menguntungkan pihak operator, karena tidak ada ketergantungan sama sekali terhadap satu supplier.
Perbedaan mendasar dari teknologi CDMA adalah sistem modulasinya. Modulasi CDMA merupakan kombinasi FDMA (Frekuensi Division Multiple Access) dan TDMA (Time Division Multiple Access). Pada teknologi FDMA, 1 kanal frekuensi melayani 1 sirkuit pada satu waktu, sedangkan pada TDMA, 1 kanal frekuensi dipakai oleh beberapa pengguna dengan slot waktuyang berbeda. Pada CDMA beberapa pengguna bisa dilayani pada waktu bersamaan dan frekuensi yang sama, dimana pembedaan satu dengan lainnya ada pada sistem coding-nya, sehingga penggunaan spektrum frekuensinya teknologi CDMA sangat efisien.
Kelebihan yang ditawarkan CDMA antara lain kualitas suara dan data, harga atau tarif yang lebih murah, investasi yang lebih kecil, dan keamanan dalam berkomunikasi (tidak mudah disadap). Teknologi GSM dengan GPRS nya akan terlibas dengan content padaCDMA karena keterbatasan akan lebar data dan aplikasi multimedia pada teknologi GSM.
C.Kelemahan teknologi CDMA jika dibandingkan dengan GSM
1. Luas cakupan BTS pada CDMA sangat tergantung dari berapa pelanggan yang menggunakannya. Beda dengan GSM, berapa pun yang menggunakan, cakupannya tetap.
2. Cakupan CDMA (maksimal) sama dengan GSM, tergantung dari berapa frekuensi yang digunakan. Makin kecil frekuensinya, makin luas cakupannya. Kalau seluler, CDMA atau GSM, menggunakan frekuensi 1900 MHz, cakupannya hanya sekitar 2 km, dengan 800 MHz bisa sampai 5-6 km. Namun, dengan 450 MHz, bisa sampai 30 km, bahkan hingga 120 km dengan antena khusus.
3. GSM berkemampuan roaming. Pemilik GSM dapat menggunakan ponsel di luar domisili atau operatornya, CDMA belum mampu.
pro dan kontra tentang situs sosial
Situs pertemanan seperti facebook,twitter,friendster,dan lain-lain di jaman sekarang ini memang wajar. karena bagaimanapun teknologi dari tahun ke tahuntidak akan habisnya.
tapi bagaimana di negara kita indonesia??
itu pertanyaan yang belum terselesaikan sampai sekarang..
Mengapa???
karena bagaimanapun situs sosial seperti facebook itu bersifat pro kontra diklangan publik ini,bagaimana tidak berikut pro konta yang dik bisa simpulkan...
PRO
menurut diksah-sah ajach dengan adanya situs sosial ini.dan sangat pasti setuju dengan adanya situs sosial seperti facebook karena bagaimanapun dengan adanaya situs sosial itu bisa menguntungkan kita:
1.kita bisa bersilaturahmi dengan temen-temen lama dan bisa menambah banyak temen
2.bisa mengetahui informasi keadaan teman sekarang
3.bisa melepaskan beban dengan menulis statusnya di akun pribadi
4.sebagai alat komunikasi dan chating
5.dan masih banyak lagi tidak bisa diungkapkan dengan kata2 saking banyaknya...hehheheheheheh
mungkin dalam sebuah situs pasti ada kelebihan dan kekurangannya,maka dari itu dik nulis pro diatas tidak adil kalo gak nulis kontra nya betul tidak..hehehhehehee
KONTRA
1.waktu kita terbuang berjam-jam dengan adanya situs sosial ini
2.dapat melupakan tugas penting seperti shalat,makan,mandi,dan lain2
3.adanya foto yang kelewat batas yaitu foto yang berbau fulgar dalam akunnya
4.adanya status yang bersifat gak mengenakan pada orang maupun perusahaan
5.biar adil no ini samai dengan no 5 di PRO..hehehhehehhe
Selengkapnya...
komputasi modern
KOMPUTASI MODERN Komputasi bisa diartikan sebagai cara untuk menyelesaikan sebuah masalah dari inputan data dengan menggunakan algoritma. Teknologi komputasi adalah aktivitas penggunaan dan pengembangan teknologi komputer, perangkat keras, dan perangkat lunak komputer. Ia merupakan bagian spesifik komputer dari teknologi informasi.
1.Pengertian Komputasi Modern
Secara umum ilmu komputasi adalah bidang ilmu yang mempunyai perhatian pada penyusunan model matematika dan teknik penyelesaian numerik serta penggunaan komputer untuk menganalisis dan memecahkan masalah-masalah ilmu (sains). Dalam penggunaan praktis, biasanya berupa penerapan simulasi komputer atau berbagai bentuk komputasi lainnya untuk menyelesaikan masalah-masalah dalam berbagai bidang keilmuan, tetapi dalam perkembangannya digunakan juga untuk menemukan prinsip-prinsip baru yang mendasar dalam ilmu.
Bidang ini berbeda dengan ilmu komputer (computer science), yang mengkaji komputasi, komputer dan pemrosesan informasi. Bidang ini juga berbeda dengan teori dan percobaan sebagai bentuk tradisional dari ilmu dan kerja keilmuan. Dalam ilmu alam, pendekatan ilmu komputasi dapat memberikan berbagai pemahaman baru, melalui penerapan model-model matematika dalam program komputer berdasarkan landasan teori yang telah berkembang, untuk menyelesaikan masalah-masalah nyata dalam ilmu tersebut
2.sejarah komputasi
ecara umum diartikan sebagai ilmu yang mempelajari baik tentang komputasi, perangkat keras (hardware) maupun perangkat lunak (software). Ilmu komputer mencakup beragam topik yang berkaitan dengan komputer, mulai dari analisa abstrak algoritma sampai subyek yang lebih konkret seperti bahasa pemrograman, perangkat lunak, termasuk perangkat keras. Sebagai suatu disiplin ilmu, Ilmu Komputer lebih menekankan pada pemrograman komputer, dan rekayasa perangkat lunak (software), sementara teknik komputer lebih cenderung berkaitan dengan hal-hal seperti perangkat keras komputer (hardware). Namun demikian, kedua istilah tersebut sering disalah-artikan oleh banyak orang.
Tesis Church-Turing menyatakan bahwa semua alat komputasi yang telah umum diketahui sebenarnya sama dalam hal apa yang bisa mereka lakukan, sekalipun dengan efisiensi yang berbeda. Tesis ini terkadang dianggap sebagai prinsip dasar dari ilmu komputer. Para ahli ilmu komputer biasanya menekankan komputer von Neumann atau mesin Turing (komputer yang mengerjakan tugas yang kecil dan deterministik pada suatu waktu tertentu), karena hal seperti itulah kebanyakan komputer digunakan sekarang ini. Para ahli ilmu komputer juga mempelajari jenis mesin yang lain, beberapa diantaranya belum bisa dipakai secara praktikal (seperti komputer neural, komputer DNA, dan komputer kuantum) serta beberapa diantaranya masih cukup teoritis (seperti komputer random and komputer oracle).
Ilmu Komputer mempelajari apa yang bisa dilakukan oleh beberapa program, dan apa yang tidak (komputabilitas dan intelegensia buatan), bagaimana program itu harus mengevaluasi suatu hasil (algoritma), bagaimana program harus menyimpan dan mengambil bit tertentu dari suatu informasi (struktur data), dan bagaimana program dan pengguna berkomunikasi (antarmuka pengguna dan bahasa pemrograman).
Berikut ini beberapa contoh komputasi modern sampai dengan lahirnya ENIAC :
* Konrad Zuse’s electromechanical “Z mesin”.Z3 (1941) sebuah mesin pertama menampilkan biner aritmatika, termasuk aritmatika floating point dan ukuran programmability. Pada tahun 1998, Z3 operasional pertama di dunia komputer itu di anggap sebagai Turing lengkap.
* Berikutnya Non-programmable Atanasoff-Berry Computer yang di temukan pada tahun 1941 alat ini menggunakan tabung hampa berdasarkan perhitungan, angka biner, dan regeneratif memori kapasitor.Penggunaan memori regeneratif diperbolehkan untuk menjadi jauh lebih seragam (berukuran meja besar atau meja kerja).
* Selanjutnya komputer Colossus ditemukan pada tahun 1943, berkemampuan untuk membatasi kemampuan program pada alat ini menunjukkan bahwa perangkat menggunakan ribuan tabung dapat digunakan lebih baik dan elektronik reprogrammable.Komputer ini digunakan untuk memecahkan kode perang Jerman.
* The Harvard Mark I ditemukan pada 1944, mempunyai skala besar, merupakan komputer elektromekanis dengan programmability terbatas.
* Lalu lahirlah US Army’s Ballistic Research Laboratory ENIAC ditemukan pada tahun 1946, komputer ini digunakan unutk menghitung desimal aritmatika dan biasanya disebut sebagai tujuan umum pertama komputer elektronik (ENIAC merupaka generasi yang sudah sangat berkembang di zamannya sejak komputer pertama Konrad Zuse ’s Z3 yang ditemukan padatahun 1941).
Sumber
http://id.wikipedia.org/wiki/Komputasi
http://phenomenalsite.co.cc/?p=46
http://www.komputasi.lipi.go.id/utama.cgi?cetakartikel&1111718762
http://www.scribd.com/doc/24593215/SEJARAH-KOMPUTASI
